M4E在背部IO接口提供了一个PS2键鼠接口、1个USB2.0接口（可作为ROG Connect接口使用）、8个USB3.0接口、2个E-SATA接口、1个SPDIF同轴光缆输出接口、清CMOS和ROG Connect按钮、双千兆网卡RJ45接口以及音频输入输出接口。

值得多说一句的是，主板背部IO接口虽然是8个USB3.0接口，且在操作系统中并没有内建NEC的USB3.0主控驱动程序，如果把键盘鼠标接在背部USB3.0接口上，也同样可以使用，所以无需担心USB键鼠接在USB3.0接口上无法操作的问题。这张主板上共有两颗NEC的USB3.0主控芯片，加上两颗VLI810一拖二Hub芯片，因此这张主板就总共有10个USB3.0芯片。除了背部接口的8个之外，还有两个在主板上作为外接接线插槽的形式出现，而华硕也附送了PCI位USB3接口背板。